1. 版权原因：火影忍者并没有在全球范围内全部下架，但在某些地区的某些平台上，由于版权原因，导致该作品被下架。

根据报道，火影忍者在某些地区的某些平台上下架的主要原因是版权问题。4399火影忍者是一款非正式授权的游戏，未获得官方授权，在某些地区的某些平台上运行被认为是侵犯了火影忍者的版权。因此，版权方要求相关平台将该游戏下架，以保护原作权益。

2. 违反管理规定：根据管理规定，《火影忍者》的某些版本在某些地区被下架。

4399火影忍者的核心实际上是流量，而在真正的游戏研发和运营环节上，4399的实力不强。虽然4399是一家知名的游戏平台，但在火影忍者这类大IP的游戏中，它并没有获得正版的授权。因此，在某些地区的某些平台上，该游戏被迫下架。

3. 恶俗形象影响：在4399平台上，《火影忍者》和一些其他恶俗游戏一同被下架。

除了版权问题和违反管理规定，火影忍者在4399平台上的恶俗形象也成为下架的原因之一。《火影忍者》以其血腥暴力的画风和暴力的游戏内容而闻名。这对于一些游戏平台来说可能产生了负面影响，所以在某些平台上，包括4399在内的一些类似游戏被迫下架。

4. 正版火影忍者手游：《火影忍者》手游则是一款正版授权的游戏。

《火影忍者》手游是一款由万代南梦宫授权、岸本齐史领衔集英社等版权方联合监修、腾讯游戏魔方工作室群自主研发的正版火影忍者格斗手游。该游戏完全遵循了原著剧情，为火影忍者的粉丝们提供了一个全新的游戏体验。正版授权的游戏相比非正版游戏，具有更加稳定和可靠的运营保障，因此在市场上也更受欢迎。

4399火影忍者被下架的原因主要是因为版权问题和违反管理规定。4399作为一个游戏平台，虽然具有一定的知名度，但在游戏研发和运营方面的实力相对较弱。因此，4399未能获得火影忍者游戏的正版授权，在一些地区的一些平台上运行该游戏便成为了一种侵权行为，版权方要求下架该游戏以保护原作权益。此外，4399平台上的火影忍者以其恶俗形象和血腥暴力的游戏内容，也在一定程度上影响了平台的形象，从而被下架。相比之下，《火影忍者》手游作为正版授权的游戏，正版授权的游戏具有更稳定和可靠的运营保障，在市场上更受欢迎。